[FEAT] Graph Multipartite connected, need to change the node shape in Graph and tests
[gargantext.git] / src / Gargantext / Core / Text / List.hs
index 735980bbc1e81b3f07ed1921ef4655fb6f5e4b43..fc9a32539605a919f0401f805576bf2c513a1a37 100644 (file)
@@ -23,7 +23,8 @@ import Data.Monoid (mempty)
 import Data.Ord (Down(..))
 import Data.Set (Set)
 import Data.Tuple.Extra (both)
-import Gargantext.API.Ngrams.Types (NgramsElement, RepoCmdM, NgramsTerm(..))
+import Gargantext.API.Ngrams.Types (NgramsElement, NgramsTerm(..))
+import Gargantext.Core.NodeStory
 import Gargantext.Core.Text (size)
 import Gargantext.Core.Text.List.Group
 import Gargantext.Core.Text.List.Group.Prelude
@@ -33,23 +34,23 @@ import Gargantext.Core.Text.List.Social.Prelude
 import Gargantext.Core.Text.Metrics (scored', Scored(..), scored_speExc, scored_genInc, normalizeGlobal, normalizeLocal, scored_terms)
 import Gargantext.Core.Types (ListType(..), MasterCorpusId, UserCorpusId)
 import Gargantext.Core.Types.Individu (User(..))
-import Gargantext.Database.Action.Metrics.NgramsByNode (getNodesByNgramsUser, getNodesByNgramsOnlyUser)
-import Gargantext.Database.Action.Metrics.TFICF (getTficf)
+import Gargantext.Database.Action.Metrics.NgramsByContext (getContextsByNgramsUser, getContextsByNgramsOnlyUser)
+import Gargantext.Database.Action.Metrics.TFICF (getTficf_withSample)
 import Gargantext.Database.Admin.Types.Node (NodeId)
 import Gargantext.Database.Prelude (CmdM)
 import Gargantext.Database.Query.Table.Ngrams (text2ngrams)
-import Gargantext.Database.Query.Table.Node (defaultList)
 import Gargantext.Database.Query.Table.NgramsPostag (selectLems)
+import Gargantext.Database.Query.Table.Node (defaultList)
 import Gargantext.Database.Query.Table.Node.Error (HasNodeError())
 import Gargantext.Database.Query.Tree.Error (HasTreeError)
 import Gargantext.Database.Schema.Ngrams (NgramsType(..), Ngrams(..))
 import Gargantext.Prelude
 import qualified Data.HashMap.Strict as HashMap
+import qualified Data.HashSet as HashSet
 import qualified Data.List    as List
 import qualified Data.Map     as Map
 import qualified Data.Set     as Set
 import qualified Gargantext.Data.HashMap.Strict.Utils as HashMap
-import qualified Data.HashSet as HashSet
 
 {-
 -- TODO maybe useful for later
@@ -61,49 +62,52 @@ isStopTerm (StopSize n) x = Text.length x < n || any isStopChar (Text.unpack x)
 
 
 -- | TODO improve grouping functions of Authors, Sources, Institutes..
-buildNgramsLists :: ( RepoCmdM env err m
+buildNgramsLists :: ( HasNodeStory env err m
                     , CmdM     env err m
                     , HasTreeError err
                     , HasNodeError err
                     )
-                 => GroupParams
-                 -> User
+                 => User
                  -> UserCorpusId
                  -> MasterCorpusId
+                 -> Maybe FlowSocialListWith
+                 -> GroupParams
                  -> m (Map NgramsType [NgramsElement])
-buildNgramsLists gp user uCid mCid = do
-  ngTerms     <- buildNgramsTermsList user uCid mCid gp (NgramsTerms, MapListSize 350)
-  othersTerms <- mapM (buildNgramsOthersList user uCid GroupIdentity)
-                      [ (Authors   , MapListSize 9)
-                      , (Sources   , MapListSize 9)
-                      , (Institutes, MapListSize 9)
+buildNgramsLists user uCid mCid mfslw gp = do
+  ngTerms     <- buildNgramsTermsList user uCid mCid mfslw gp (NgramsTerms, MapListSize 350)
+  othersTerms <- mapM (buildNgramsOthersList user uCid mfslw GroupIdentity)
+                      [ (Authors   , MapListSize 9, MaxListSize 1000)
+                      , (Sources   , MapListSize 9, MaxListSize 1000)
+                      , (Institutes, MapListSize 9, MaxListSize 1000)
                       ]
 
   pure $ Map.unions $ [ngTerms] <> othersTerms
 
 
 data MapListSize = MapListSize { unMapListSize :: !Int }
-
-buildNgramsOthersList ::( HasNodeError err
-                        , CmdM     env err m
-                        , RepoCmdM env err m
-                        , HasTreeError err
-                        )
-                        => User
-                        -> UserCorpusId
-                        -> GroupParams
-                        -> (NgramsType, MapListSize)
-                        -> m (Map NgramsType [NgramsElement])
-buildNgramsOthersList user uCid _groupParams (nt, MapListSize mapListSize) = do
-  allTerms  :: HashMap NgramsTerm (Set NodeId) <- getNodesByNgramsUser uCid nt
-
-  -- | PrivateFirst for first developments since Public NodeMode is not implemented yet
+data MaxListSize = MaxListSize { unMaxListSize :: !Int }
+
+buildNgramsOthersList :: ( HasNodeError err
+                         , CmdM     env err m
+                         , HasNodeStory env err m
+                         , HasTreeError err
+                         )
+                      => User
+                      -> UserCorpusId
+                      -> Maybe FlowSocialListWith
+                      -> GroupParams
+                      -> (NgramsType, MapListSize, MaxListSize)
+                      -> m (Map NgramsType [NgramsElement])
+buildNgramsOthersList user uCid mfslw _groupParams (nt, MapListSize mapListSize, MaxListSize maxListSize) = do
+  allTerms  :: HashMap NgramsTerm (Set NodeId) <- getContextsByNgramsUser uCid nt
+
+  -- PrivateFirst for first developments since Public NodeMode is not implemented yet
   socialLists :: FlowCont NgramsTerm FlowListScores
-    <- flowSocialList MySelfFirst user nt ( FlowCont HashMap.empty
+    <- flowSocialList mfslw user nt ( FlowCont HashMap.empty
                                                       $ HashMap.fromList
                                                       $ List.zip (HashMap.keys allTerms)
                                                                  (List.cycle [mempty])
-                                           )
+                                    )
   let
     groupedWithList = toGroupedTree {- groupParams -} socialLists allTerms
 
@@ -115,10 +119,12 @@ buildNgramsOthersList user uCid _groupParams (nt, MapListSize mapListSize) = do
     listSize = mapListSize - (List.length mapTerms)
     (mapTerms', candiTerms) = both HashMap.fromList
                             $ List.splitAt listSize
+                            $ List.take maxListSize
                             $ List.sortOn (Down . viewScore . snd)
                             $ HashMap.toList tailTerms'
 
-  pure $ Map.fromList [( nt, (toNgramsElement stopTerms)
+
+  pure $ Map.fromList [( nt, List.take maxListSize $ (toNgramsElement stopTerms)
                           <> (toNgramsElement mapTerms )
                           <> (toNgramsElement $ setListType (Just MapTerm      ) mapTerms' )
                           <> (toNgramsElement $ setListType (Just CandidateTerm) candiTerms)
@@ -127,7 +133,7 @@ buildNgramsOthersList user uCid _groupParams (nt, MapListSize mapListSize) = do
 
 getGroupParams :: ( HasNodeError err
                   , CmdM     env err m
-                  , RepoCmdM env err m
+                  , HasNodeStory env err m
                   , HasTreeError err
                   )
                => GroupParams -> HashSet Ngrams -> m GroupParams
@@ -141,28 +147,34 @@ getGroupParams gp _ = pure gp
 -- TODO use ListIds
 buildNgramsTermsList :: ( HasNodeError err
                         , CmdM     env err m
-                        , RepoCmdM env err m
+                        , HasNodeStory env err m
                         , HasTreeError err
                         )
-                        => User
-                        -> UserCorpusId
-                        -> MasterCorpusId
-                        -> GroupParams
-                        -> (NgramsType, MapListSize)
-                        -> m (Map NgramsType [NgramsElement])
-buildNgramsTermsList user uCid mCid groupParams (nt, _mapListSize)= do
-
--- | Filter 0 With Double
+                     => User
+                     -> UserCorpusId
+                     -> MasterCorpusId
+                     -> Maybe FlowSocialListWith
+                     -> GroupParams
+                     -> (NgramsType, MapListSize)
+                     -> m (Map NgramsType [NgramsElement])
+buildNgramsTermsList user uCid mCid mfslw groupParams (nt, _mapListSize)= do
+
+-- Filter 0 With Double
 -- Computing global speGen score
-  allTerms :: HashMap NgramsTerm Double <- getTficf uCid mCid nt
+  printDebug "[buildNgramsTermsList: Sample List] / start" nt
+  allTerms :: HashMap NgramsTerm Double <- getTficf_withSample uCid mCid nt
+  printDebug "[buildNgramsTermsList: Sample List / end]" (nt, HashMap.size allTerms)
 
-  -- | PrivateFirst for first developments since Public NodeMode is not implemented yet
+  printDebug "[buildNgramsTermsList: Flow Social List / start]" nt
+  -- PrivateFirst for first developments since Public NodeMode is not implemented yet
   socialLists :: FlowCont NgramsTerm FlowListScores
-    <- flowSocialList MySelfFirst user nt ( FlowCont HashMap.empty
+    <- flowSocialList mfslw user nt ( FlowCont HashMap.empty
                                                       $ HashMap.fromList
                                                       $ List.zip (HashMap.keys   allTerms)
                                                                  (List.cycle     [mempty])
-                                           )
+                                    )
+  printDebug "[buildNgramsTermsList: Flow Social List / end]" nt
+
   let ngramsKeys = HashMap.keysSet allTerms
 
   groupParams' <- getGroupParams groupParams (HashSet.map (text2ngrams . unNgramsTerm) ngramsKeys)
@@ -202,20 +214,23 @@ buildNgramsTermsList user uCid mCid groupParams (nt, _mapListSize)= do
   userListId    <- defaultList uCid
   masterListId  <- defaultList mCid
 
-  mapTextDocIds <- getNodesByNgramsOnlyUser uCid
+  mapTextDocIds <- getContextsByNgramsOnlyUser uCid
                                             [userListId, masterListId]
                                             nt
                                             selectedTerms
 
+
+  -- printDebug "mapTextDocIds" mapTextDocIds
+
   let
     groupedTreeScores_SetNodeId :: HashMap NgramsTerm (GroupedTreeScores (Set NodeId))
     groupedTreeScores_SetNodeId = HashMap.filter (\g -> Set.size (view gts'_score g) > 1) -- removing hapax
                                 $ setScoresWithMap mapTextDocIds (groupedMonoHead <> groupedMultHead)
 
 
-  printDebug "groupedTreeScores_SetNodeId" groupedTreeScores_SetNodeId
+  --printDebug "groupedTreeScores_SetNodeId" groupedTreeScores_SetNodeId
 
-  -- Coocurrences computation
+  -- Coocurrences computation
   --, t1 >= t2 -- permute byAxis diag  -- since matrix symmetric
   let mapCooc = HashMap.filter (>1) -- removing cooc of 1
               $ HashMap.fromList [ ((t1, t2), Set.size $ Set.intersection s1 s2)
@@ -247,8 +262,8 @@ buildNgramsTermsList user uCid mCid groupParams (nt, _mapListSize)= do
 
       -- filter with max score
     partitionWithMaxScore = HashMap.partition (\g -> (view scored_genInc $ view gts'_score g)
-                                               > (view scored_speExc $ view gts'_score g)
-                                          )
+                                                   > (view scored_speExc $ view gts'_score g)
+                                              )
 
     (monoScoredIncl, monoScoredExcl) = partitionWithMaxScore monoScored
     (multScoredIncl, multScoredExcl) = partitionWithMaxScore multScored
@@ -256,53 +271,63 @@ buildNgramsTermsList user uCid mCid groupParams (nt, _mapListSize)= do
   -- splitAt
   let
     -- use % of list if to big, or Int if to small
-    listSizeLocal = 1000 :: Double
+    mapSize = 1000 :: Double
+    canSize = mapSize * 2 :: Double
     inclSize = 0.4  :: Double
     exclSize = 1 - inclSize
 
-    splitAt' n' = (both (HashMap.fromList)) . (List.splitAt (round $ n' * listSizeLocal))
+    splitAt' max' n' = (both (HashMap.fromList)) . (List.splitAt (round $ n' * max'))
     sortOn   f  = (List.sortOn (Down . (view (gts'_score . f)) . snd)) . HashMap.toList
 
+    monoInc_size n = splitAt' n $ monoSize * inclSize / 2
+    multExc_size n = splitAt' n $ multSize * exclSize / 2
+
 
-    monoInc_size = splitAt' $ monoSize * inclSize / 2
-    (monoScoredInclHead, _monoScoredInclTail) = monoInc_size $ (sortOn scored_genInc) monoScoredIncl
-    (monoScoredExclHead, _monoScoredExclTail) = monoInc_size $ (sortOn scored_speExc) monoScoredExcl
+    (mapMonoScoredInclHead, monoScoredInclTail) = monoInc_size mapSize $ (sortOn scored_genInc) monoScoredIncl
+    (mapMonoScoredExclHead, monoScoredExclTail) = monoInc_size mapSize $ (sortOn scored_speExc) monoScoredExcl
 
-    multExc_size = splitAt' $ multSize * exclSize / 2
-    (multScoredInclHead, multScoredInclTail) = multExc_size $ (sortOn scored_genInc) multScoredIncl
-    (multScoredExclHead, multScoredExclTail) = multExc_size $ (sortOn scored_speExc) multScoredExcl
+    (mapMultScoredInclHead, multScoredInclTail) = multExc_size mapSize $ (sortOn scored_genInc) multScoredIncl
+    (mapMultScoredExclHead, multScoredExclTail) = multExc_size mapSize $ (sortOn scored_speExc) multScoredExcl
 
-  printDebug "stopWords" stopTerms
+
+    (canMonoScoredIncHead , _) = monoInc_size canSize $ (sortOn scored_genInc) monoScoredInclTail
+    (canMonoScoredExclHead, _) = monoInc_size canSize $ (sortOn scored_speExc) monoScoredExclTail
+
+    (canMulScoredInclHead, _)  = multExc_size canSize $ (sortOn scored_genInc) multScoredInclTail
+    (canMultScoredExclHead, _) = multExc_size canSize $ (sortOn scored_speExc) multScoredExclTail
 
 ------------------------------------------------------------
     -- Final Step building the Typed list
     -- Candidates Terms need to be filtered
   let
     maps = setListType (Just MapTerm)
-        $  monoScoredInclHead
-        <> monoScoredExclHead
-        <> multScoredInclHead
-        <> multScoredExclHead
+        $  mapMonoScoredInclHead
+        <> mapMonoScoredExclHead
+        <> mapMultScoredInclHead
+        <> mapMultScoredExclHead
 
     -- An original way to filter to start with
-    cands = setListType (Just CandidateTerm)
-          $  {- monoScoredInclTail
-          <> monoScoredExclTail
-          <> -} multScoredInclTail
-          <>  multScoredExclTail
+    cands = setListType (Just CandidateTerm) 
+          $ canMonoScoredIncHead
+          <> canMonoScoredExclHead
+          <> canMulScoredInclHead
+          <> canMultScoredExclHead
 
+  -- TODO count it too
     cands' = setListType (Just CandidateTerm)
-          {-$  groupedMonoTail
+          {-\$  groupedMonoTail
           <>-} groupedMultTail
 
+    -- Quick FIX
+    candNgramsElement = List.take 1000
+                      $ toNgramsElement cands <> toNgramsElement cands'
+
     result = Map.unionsWith (<>)
        [ Map.fromList [( nt, toNgramsElement maps
-                          <> toNgramsElement cands
-                          <> toNgramsElement cands'
                           <> toNgramsElement stopTerms
+                          <> candNgramsElement
                       )]
        ]
 
-  -- printDebug "result" result
-
   pure result