WIP Gargantext/Text/Terms/WithList

[SPECS] index a corpus with term list.

[CLI] spliting executables into server and cli. Fixing parser.

[FEAT] Adding External module for IMT community manager
[CLEAN] adding signatures, removing unused imports, fixing shadowing...

[SEARCH] Adding the authors for the demo site.

[FEAT] TEXT SEARCH API done (can be adapted for annuaire).

[FIX] mime files for a dependency (servant-static).

[FACET] Corpus ok.

Merge branch 'master' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext

[LOGS] adding log to dev app.

Add fisWithSizePolyMap and a comment

cosmetics

[FIX] swagger again.

[FIX] text message.

[GRAPH] Old graph format of gargantext utils to convert.

[DEP] commenting client dep.

[DOC] adding database instructions.

[DATA] adding a csv corpus functions.

[API] polymorphic node for rest api.

[Community] Annuaire added, ok.

Merge branch 'master' into community

[BASHQL] fix function exposition.

[MERGE] bashql + pipeline.

cosmetics

[BASHQL] adding tree command.

[BASHQL] can post Corpus with its Documents as children (simple and naive implementation).

[BASHQL] Node' hierarchy (post/get/update semantics to get).

[BASHQL] value ok + returning value ok.

[BASHQL(FIX)] adding semantics.

[BASHQL] adding semantics.

[BASQHL] first basic function and todo list.

[BASHQL] doc + spec + first example.

[FIX] overloaded Strings needed in csv parser.

[TEXTFLOW] pipeline and workflow become textflow.

[FIX] descending sort inspired by https://ro-che.info/articles/2016-04-02-descending-sort-haskell (thx @np for this great link.

[TEXTLINE] adding CSV format parser.

Merge branch 'pipeline'

[TYPES] Terms and Human Lang types fusion.

[WORKFLOW] clean, issue in map2mat: diagonal == 0.

Some progress on workflow, the data2graph fails because of unknown nodes, see the TODO

Fix performance issue due to infinit result of splitEvery

[WORKFLOW] cleaned, adding data2graph.

[FIX] compiles now (@np maybe you can add your fix now).

[MERGE] needs fix.

Untested fix of incExcSpeGen_sorted'

[COOC FILTERING] workflow done but optimization issue.

[Map list automatic filtering] adding doc.

[CLEAN] removing unused code.

Merge branch 'pipeline'

[Scored filtering] adding doc.

[CLEAN] code kmeans.

[STAT] map list creation adding kmeans to splitBy inclusion score.

Merge branch 'pipeline'

[Terms Selection] takeSome function which filters with inclusion/exclusion (relevance) and gen/spe.

[DEP] config.

Merge branch 'pipeline'

Ignoring local folders.

[Scores] Documentation.

[FIX scores]

[Scores] Inclusion/Exclusion and Specificity/Genericity ok with my tests.

Add missing lifts

need fix

[FEAT] gen/spe statistics.

Gargantext.Text.Metrics.FrequentItemSet: export more functions

diag: no need for type annotation

Add LANGUAGE ScopedTypeVariables

[SCORE] spegen quality tested, need to add test in comments.

Merge remote-tracking branch 'origin/pipeline' into pipeline

[FIX] multiterms FR extraction.

0002-Minor-build-packaging-tweaks.patch by npouillard

0001-Basic-polymorphic-version-of-FrequentItemSet.patch by npouillard

Minor build/packaging tweaks

Basic polymorphic version of FrequentItemSet

[FEAT] specificity / genericity and inclusion / exclusion metric.

[FIX] Corenlp lems -> using stem.

[COUNT] renaming file and generic function.

[FIX] fix cooc behavior.

[Pipeline] clustering with C++ Louvain bindings, ok.

[TERMS] adding type MonoMulti.

[RENAME] name and newtypes for createIndices.

[PIPELINE] adding clustering louvain.

[CLEAN] imports for pipeline.

Merge branch 'pipeline'

[Pipeline] ok until clustering.

small change in createIndexes

New cooc2mat

Add map2mat

Fix mat2cooc

[FEAT] Cooc -> Matrix conversions tools.

ref.

[DEP] + warning for ghc.

[Types] Phylo

[FIX] clustering-louvain dep (readme).

[FEAT] adding pipeline.

[CONTEXT]

[FIX] minimax with accelerate

[FEAT] adding clustering louvain.

[FEAT] Adding Graph type for the REST api.

[MERGE] distances for Graph.

[FEAT] cooc added for pipeline