Merge branch 'dev' into dev-phylo

[Graph][WIP] Cooc 2 graph and missing file.

[Phylo][WIP] File Format parameters.

[Ngrams/Graph] inserted into lists.

[FEAT][Text][Metrics] TFICF.

[FIX] MapList default terms -> Candidate + Cosmetics import.

Merge branch 'dev-ngrams-table' into dev

[MERGE] fix merge
[NgramsTable] fix order and bugs of groups

[NgramsTable][WIP] Get / Group / ungroup.

[NGRAMS] Extract the listId parameter

[FLOW] Use `Map a (Map NgramsType b)` instead of `Map (NgramsT a) b`

[FLOW] optim ok.

[FLOW] comment out grouping

update runCmdDev

Naming typo

[IMPORT] Fix build issues

[FILE] missing.

[WIP] BIN import corpus CLI.

[FLOW] Use a Data.Set to avoid extra insertions of the same ngram

[FLOW] mapNodeIdNgrams directly create the inner maps

[FLOW] indexing does not need typed ngrams

[FLOW] NgramsT is a Functor

[FLOW] Inline Flow.indexNgrams

[FLOW] inline single use function

[Ngrams Table] Front and Back implemented (but need next step for optimization and behavior of group controls (multichild issue)).

[NGRAMS-TABLE] WIP add ngramsType param to PUT

[NgramsTable] WIP adding NgramsTypeId newtype.

[Ngrams] List and Group management, SQL queries fixed.

[TYPES][Phylo] Fix TH.

[TYPES][PHYLO] removing Upper first letter.

[NewType] FromField fix.

[NewType] Merge, NodeNgram* fix.

[NewType] NodeId implemented.

[NEWTYPE] WIP Error in Servant to fix.

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-ngrams-table' into dev

[NGRAM-TABLE] remove RETURNING

[NGRAM-TABLE] updateNodeNgrams returns () now

[NGRAMS-TABLE] use float8

Merge branch 'dev-ngrams-table' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[NGRAMS-TABLE] use real

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-ngrams-table' into dev

[NGRAMS-TABLE] comment out the weights part 2

[NGRAMS-TABLE] comment out the weights

[NGRAMS-TABLE] double is called double precision

[NGRAMS-TABLE] Attempt at fixing updateNodeNgrams query

Fix the NgramsPatch type

[FIX] dep install

Merge branch 'dev-ngrams-table' into dev

[HANDLING] Errors, catchNodeError removed.

[HANDLING] Error, prism for ServantErr.

[ERROR] Fix NodeUser error.

[ERROR] More errors handled now thanks to ErrorMonad.

[ERRORS] Handling: adding some errors in DB.

[ERROR] Handling.

[DEP] missing dep.

[Database] Cosmetics.

[NGRAMS-TABLE]: Fix JSON instance for NgramsTablePatch

Merge branch 'dev-parsers' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[Text][Parsers] Isidore query to HyperdataDocument : OK.

[NGRAMS-TABLE] avoid warnings

[NGRAMS] Add Versioned to the API and implement tableNgramsPatch

[Database] NodeNgramsNgrams minor change.

Merge branch 'dev-parsers' of https://gitlab.iscpif.fr/gargantext/haskell-gargantext into dev-parsers

Update ./install

[Database] NodeNgramsNgrams cosmetics.

[Text][Parsers][Isidore] acceptable query for next step (typing the result).

[Text][Parsers][Isidore] funcWith for contains.

Fork hsparql to use structureContent

[TEXT][Parsers][Isidore] working query.

[TEXT][Parsers][Isidore] fix merge with local changes.

Isidore: make the sparql request using Wreq because httpS is required

[TEXT][PARSERS] Isidore update query.

[TEXT][PARSERS] Isidore.

[MERGE] master and masterAfterDemo.

Typo

[Graph] Legend.

[Database] Clean code.

[Database] Clean tables.

[Database] Refactor functions accessing the database

[Database][SQL] Schema and insertUsers function.

[FIX] SQL query OR.

[SearchIn] Corpus API route : corpus/{id}/search

[FLOW][Database] ngrams extraction and insertion.

[Search][Graph][FacetPair] with limit and offset, union of pairs.

[Graph Search] union of pairs.

[Graph Search] FacetPaired.

[Query] Search in Corpus To FacetDoc.

[GRAPH][Search] Query -> FacetDoc.

[API] Graph with metadata.

[INSTALL] tested on Debian 9.4 and Ubuntu 16.4.

[Database][Search] semantics ok.

[SEARCH] full text queries: Database and Corpus.

[Query] clean.

[Database][Query] search for doc 2 authors

[FIX] insertOn conflict do Nothing.

[FIX] deprecated function compilation. ok.

Merge remote-tracking branch 'origin/rest-fix'

[NodeNgrams] Insertion fix (do nothing on conflict).

Add a basic support for limit and offset to getNgramsTableData

[NGRAMS][LIST] getOrMk List.

Merge branch 'tsvector'