Merge branch 'dev' into dev-getting-started-readme

[nix] use gfortran.cc.lib

Merge branch 'dev' into dev-getting-started-readme

[DOC] preparing maxClique phylo

[API][GRAPH] cosmetics to prepare next step.

[API][CLEAN] cosmetics.

[FEAT][FIX] Export hash, sort needed.

[FEAT] Export with Hash (Tree inspired from Merkle Tree).

[FEAT] Export Corpus with Document with Ngrams.

[DB][OPTIM] index (wip).

[API][DB] Pairing tools: get pairs and pairWith.

[API][PAIRING] adding route to pair a corpus with an annuaire (need to note this in db)

[API][Pairs] search enabled again.

[FEAT] Enabling again: Pairs CorpusId AnnuaireId (unoptimized for now).

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-sql-run-insert-deprecation-fix' into dev-merge

[DB] runInsertMany is deprecated, using runInsert_

[README] stack --docker

[BOARD] enabling it in the Tree + cosmetics.

[README] getting started updates, added .nix files, docker fixes

[Hyperdata] Folder == Corpus for now.

[FIX] Lang to upload + instances

[UPLOAD] 2 others file format

[FIX] Upload CSV + new Lang all

Merge branch 'dev' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[UPLOAD] adding CSV Garg v3 parser.

[API] add Lang (All)

[API] Code edit.

[FIX] Corpus Hyperdata type.

[FIX] Markdown

Merge branch 'dev-db' into dev

[DB] Optim Select Table sort by date.

[TYPES] Node Hyperdata for Json | Markdown fields.

[WIP] update hyperdata.

[API] Query route simple to get started

[DB] Optim Indexes (DELETE)

[API] Add to corpus with query

[API] route for upload WIP.

[DB] flow WIP

Merge branch 'dev' into dev-db-schema

[FIX][API][ASYNC] back to deps to servant-job.

[FIX] Async routes.

[API][FLOW][Upload] just for CsvHal

[API][FLOW] Upload file for CsvHalFormat (WIP)

[FIX][API] upload url encoded OK

[MERGE] fix but weird behavior of git here, Nobody did push anything, I was last one commit and I have to fix the merge when pulling back

[DOC] comments API.

[DB] optim cooc

[FIX] insertion without duplicates.

[DB][OPTIM] WIP

[DB][Optim] Cooc without groups (wip).

[DB] Master User Texts

[DB] Node_NodeNgrams_NodeNgrams insertion in flowList (WIP).

[FIX] lib servant-job upgrade

[API][FIX] urlencoded

[FIX] warnings

[API] upload

[API][Async] withFile route ok

[API][ASYNC] WIP

[DB][OPTIM] WIP

[DB][Optim] Cooc without groups (wip).

[DB] Master User Texts

[DB] Node_NodeNgrams_NodeNgrams insertion in flowList (WIP).

[MERGE] Ngrams repos fixes

Unfinished refactoring

[GRAPH] Type graph version is list version.

Merge branch 'dev' of https://gitlab.iscpif.fr/gargantext/haskell-gargantext into dev

[NGRAMS-TABLE] Refactoring to make more explicit the repo access

[GRAPH] Version number of List in Graph Type

[DB] Schema Node_Cgrams_Cgrams

[DB] Schema update.

[DB][FACT] WIP

[DB][FIX] SQL NodeNgrams query.

[DB] insert on conclict.

[DB] Node_NodeNgrams_NodeNgrams

[DB][WIP] NodeNgrams

[DB] Schema + triggers.

[FIX] graph clustering.

[FIX]

[FIX] Ngrams repo missing directory.

[DATABASE] Postgres upgrade + schema + triggers (use gargantext-init to configure it).

[ADM] install script.

[ADM] nginx conf

[ADMIN] dependences.

[ADMIN] script to install (WIP).

[Metrics] optim

[GarGraph] Missing File. GarGraph = Garage à graphs.

[GarGraph] Database triggers / inserts.

[CLEAN] code indentation

[GRAPH] fix parameters of clustering (for tests).

[CI] config.

Merge branch 'dev-api-node-count' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[TableResult] refactor to use TableResult type

Also, (length allDocs) queries were replaced by proper count queries
from the DB which is more efficient, except for the table query (this is
a bit more complex).

[FIX] mkNode.

Merge branch 'dev' into dev-api-node-count

[GRAPH] clean orphan nodes (fix)

[GRAPH] clean orphan nodes

[GRAPH] removing trace + unconnected nodes (some left still).

Merge branch 'dev-corpus-add-file' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-corpus-add-file

[API][Node] corpus/<corpusId>/add/file endpoint

[GRAPH] fix diag data.