Merge branch 'dev' into update-build-shell.nix

update shell.nix nixpkgs

update build-shell.nix and add gfortran as extra-libraries

this makes `stack build --nix` work without extra system dependencies

[FIX] SQL read only

[list] add HTML list get endpoint

[OPTIM] concurrent threads (fix mem leaks)

[FIX] Graph concurrency.

pin nixpkgs and prepare shell.nix

[API] get / put NgramsList (todo: tests)

[FIX] Tree root design fun.

[NodeUser] fake data (basic)

[API] Node User

[FEAT] NodeUser type.

[PAR] fib route

[FIX] Tree filtering.

Merge branch 'dev' into dev-phylo

working on maxClique

[FEAT] getMaxCliques function.

Merge branch 'dev-phylo' into dev

Merge branch 'dev-phylo' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-phylo

working on export

[FIX] merge

[Dashboard] allow storing charts in the dashboard node

[static] use file server, this way index.html is served by default

[static] fix API ordering

Static (at root) has to be last so that API matches.

[static] use servant static file server

This is instead of the Servant.Static.TH which bundles the files at
compilation into the binary.

[FIX] Annuaire / Team Node creation

Merge branch 'dev-merge' into dev-dashoard-charts

Merge branch 'dev' into dev-dashoard-charts

cosmetics reading

Merge branch 'dev-dashoard-charts' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

Merge branch 'dev-getting-started-readme' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

Merge branch 'dev' into dev-getting-started-readme

add branch w and t

[annuaire] typo fix in annuaire async upload url

[Annuaire] async file upload stub

[nix] use gfortran.cc.lib

[INIT] add main folders.

Merge branch 'dev' into dev-getting-started-readme

[DOC] preparing maxClique phylo

[API][GRAPH] cosmetics to prepare next step.

[Node] add "charts" in JSONField

This is to save charts in dashboard.

[API][CLEAN] cosmetics.

[FEAT][FIX] Export hash, sort needed.

[FEAT] Export with Hash (Tree inspired from Merkle Tree).

[FEAT] Export Corpus with Document with Ngrams.

[DB][OPTIM] index (wip).

[API][DB] Pairing tools: get pairs and pairWith.

[API][PAIRING] adding route to pair a corpus with an annuaire (need to note this in db)

[API][Pairs] search enabled again.

[FEAT] Enabling again: Pairs CorpusId AnnuaireId (unoptimized for now).

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-sql-run-insert-deprecation-fix' into dev-merge

[DB] runInsertMany is deprecated, using runInsert_

[README] stack --docker

[BOARD] enabling it in the Tree + cosmetics.

[README] getting started updates, added .nix files, docker fixes

[Hyperdata] Folder == Corpus for now.

[FIX] Lang to upload + instances

[UPLOAD] 2 others file format

[FIX] Upload CSV + new Lang all

Merge branch 'dev' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[UPLOAD] adding CSV Garg v3 parser.

[API] add Lang (All)

[API] Code edit.

[FIX] Corpus Hyperdata type.

[FIX] Markdown

Merge branch 'dev-db' into dev

[DB] Optim Select Table sort by date.

[TYPES] Node Hyperdata for Json | Markdown fields.

[WIP] update hyperdata.

[API] Query route simple to get started

Merge branch 'testing' into stable

[DB] Optim Indexes (DELETE)

[API] Add to corpus with query

[API] route for upload WIP.

[DB] flow WIP

Merge branch 'dev' into dev-db-schema

[FIX][API][ASYNC] back to deps to servant-job.

[FIX] Async routes.

[API][FLOW][Upload] just for CsvHal

[API][FLOW] Upload file for CsvHalFormat (WIP)

[FIX][API] upload url encoded OK

[MERGE] fix but weird behavior of git here, Nobody did push anything, I was last one commit and I have to fix the merge when pulling back

[DOC] comments API.

[DB] optim cooc

[FIX] insertion without duplicates.

[DB][OPTIM] WIP

[DB][Optim] Cooc without groups (wip).

[DB] Master User Texts

[DB] Node_NodeNgrams_NodeNgrams insertion in flowList (WIP).

[FIX] lib servant-job upgrade

[API][FIX] urlencoded

[FIX] warnings

[API] upload

Merge branch 'master' into stable

Merge branch 'testing'

add adaptative and constante sea level elevation

[API][Async] withFile route ok

[API][ASYNC] WIP

[DB][OPTIM] WIP