[STACK LTS] upgrade + external API deps.

working on temporal matching

docker: add Dockerfile, docker-compose for postgres

to the level 1

add the phyloBase, Fis and Cooc

add Wos parser

working on the adaptative matching

[FIX] PubMed api ok.

[FIX] Hyperdata pref.

[FEAT FIX] Search in corpus + score nullable and category nullable too.

[FEAT] search in Trash

[REFACTO] WIP

[REFACTORING] Hyperdata Nodes (Texts for now).

[FIX] Flow force TextNodeId.

[FLOW] order of mkNode.

[FIX] List with TFICF.

[DEV] Flow + Main + cosmetics on Learn.

[FIX] table api.

[FIX] empty query.

[FIX] missing file.

[FIX] backend route.

[TABLE] search in docs, result as Facet.

some addings linked to the memiescape

[LEARN API]

[FIX] Tree NodeTexts + DB.

[FIX] Add Category not null.

[API/DB] Fav AND Delete in NodeNode => category as Int wher 0 = Deleted, 1 or null = Neutral, 2 = Favorite.

[New Node] NodeTexts to Learn Texts and display it.

[FEAT] Learn function to export models

[FIX] Build.

[REFACTO] FLOW DEV

[LEARN] moreLike func and apply.

[PARSER] date + schema

RENAME FIX

[FEAT] [LEARN] REFACTO.

[COSMETICS]

add a recursive way to transpose links from level 1 to level 2

[METRICS] FACTO

Merge remote-tracking branch 'home/dev' into dev-merge

MERGE

[MERGE]

Generalize error type to make less use of ServantErr

[PHYLO] fix parameters for conference Oslo.

[PHYLO] merge

[MISC] fixes.

[OPTIM] Query Occ Ngrams.

[PHYLO] backend POST/GET ok.

[PHYLO] backend POST/GET DB written.

[PARSING] CSV GARG V3 (is back).

[EXT API] Pubmed upgrade.

[API] External API Pubmed connected.

[FACTO] Type Class and some Instances : Flow Corpus.

merge with dev

add sort branch by birth date

[DEVOPS] clean / mv / reorder.

[DB] config postgres script.

add branch label

[API ToSchema FIX] Swagger documentation TODO.

[External API] list of available APIs through API.

[PHYLO] Api backend render svg properly now (without escaping).

Merge branch 'dev-phylo' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[PHYLO] SVG generation in ghci ok.

merge done

adding the ngrams dynamics

[PHYLO] flow phylo implemented (not optimized yet).

[PHYLO) Backend + flowPhylo + SVG.

[FLOW PHYLO] Compiles but errors at runtime test.

[PHYLO] implementation to Garg Flow (main fun ok).

Merge branch 'dev-phylo' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

still some refactoring

some refactoring & adding generality, specifivity, etc for the ngrams

Merge branch 'dev-phylo' into dev-merge

[OPTIM] Database index.

[GRAPH] Metadata with ListId

[TODO] remove title in FacetDoc.

[FEAT] New ngrams list + fix isidore api.

Update the search API

[REFACT] before scoring new ngrams lists.

Merge branch 'dev' of https://gitlab.iscpif.fr/gargantext/haskell-gargantext into dev-phylo

[ADM] missing pkg.

Merge branch 'dev' into dev-phylo

[FIX] quick fix for the text search (need to debug still).

Merge branch 'dev-corpus-with-filetype' into dev

[FIX] API post with param.

[API] Connection to Isidore.

upload: some attempts to add query param "fileType" to upload api

[REFACTO] ngrams unsupervised.

[FIX] warning + cli import binary to test unsupervised.

[WORKFLOW] Unsupervised ngrams extraction implemented.

[NGRAMS] Unsupervised extraction OK.

[FIX] Graph filter.

Merge branch 'dev' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[NGRAMS API] POST now accepts an optional listType

[TERMS] clean/refacto before integration to workflow.

[MERGE][GRAPH FIX] edges weight + confluence in graph.

add the reBranch

[GRAPH] With FGL without IGraph, runTest is OK.

[GRAPH] IGraph types and functions extracted from Proxemy.

[CONF] Docker set to false by default.

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-corpus-upload-file-endpoint' into dev

[ISIDORE API] FIX ReplyOnly.