Unfinished refactoring

Merge branch 'dev' of https://gitlab.iscpif.fr/gargantext/haskell-gargantext into dev

[NGRAMS-TABLE] Refactoring to make more explicit the repo access

[GRAPH] Version number of List in Graph Type

[DB] Schema Node_Cgrams_Cgrams

[DB] Schema update.

[DB][FACT] WIP

[DB][FIX] SQL NodeNgrams query.

[DB] insert on conclict.

[DB] Node_NodeNgrams_NodeNgrams

[DB][WIP] NodeNgrams

[DB] Schema + triggers.

[FIX] graph clustering.

[FIX]

[FIX] Ngrams repo missing directory.

[DATABASE] Postgres upgrade + schema + triggers (use gargantext-init to configure it).

[ADM] install script.

[ADM] nginx conf

[ADMIN] dependences.

[ADMIN] script to install (WIP).

[Metrics] optim

[GarGraph] Missing File. GarGraph = Garage à graphs.

[GarGraph] Database triggers / inserts.

[CLEAN] code indentation

[GRAPH] fix parameters of clustering (for tests).

[CI] config.

Merge branch 'dev-api-node-count' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[TableResult] refactor to use TableResult type

Also, (length allDocs) queries were replaced by proper count queries
from the DB which is more efficient, except for the table query (this is
a bit more complex).

[FIX] mkNode.

Merge branch 'dev' into dev-api-node-count

[GRAPH] clean orphan nodes (fix)

[GRAPH] clean orphan nodes

[GRAPH] removing trace + unconnected nodes (some left still).

Merge branch 'dev-corpus-add-file' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-corpus-add-file

[API][Node] corpus/<corpusId>/add/file endpoint

[GRAPH] fix diag data.

[GRAPH] Db fix.

Merge branch 'dev-optim-ngrams-table' into dev-merge

missing file

[GRAPH][OPTIM] store or compute if needed only.

[API] attempt to implement node count in API

[GRAPH] API update (WIP).

[NGRAMS TABLE] Improve listNgramsChangedSince for negative version numbers

[NGRAMS TABLE] refactor tableNgramsPull and expose listNgramsChangedSince

[GRAPH] Comments during meeting.

API: use more specific names than "id" in captures

Fix formatting

Improve ToSchema instances

[API][ROUTE] count tab result.

[PAIRING][COSMETICS]

getTableNgrams more timing infos

schema.sql add indices to support queryNgramsOccurrencesOnlyByNodeUser

getTableNgrams: tweak timing formatting

getTableNgrams: display timing information

[FIX] warnings

[PAIR][WIP] NodeNgrams -> NodeNodeNgrams, needs tests.

[HASH] adding argon2

Update to lasted version of servant-job

[FIX] strict.

[FIX] servant-job instances.

[STACK] upgrade.

[SCRAPER] setup the new version of addToCorpus with servant-job

[BIN] csv hal format.

[Annuanire][Contact] Route + script.

ServantJob, addToCorpus

[FIX][WIP] Orchestrator is back.

[Node Type] adding team.

[SPECs] Collab + demo fix.

[SECU] Doc routes.

[DOC] typo.

Merge branch 'dev-maxClique' into dev

[COSMETICS] max cliques, cut function lines.

[FIX] warnings.

[FEAT][MAXCLIQ] adding type.

[FEAT] MaxClique.

[FEAT][FOREST][WIP] which folder at root of the user.

[WIP] G.P.Utils.shuffle + maxClique.

Merge branch 'dev-phylo' into dev-merge

last commit before bruno's workshop

work in progress

fix accuracy

fix the grand bleu effect

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-auth' into dev-merge

looking at the recall

optimisation for temporal matching

Secure API part 3: define a withAccess combinator and use it at most places

Fix ToSchema typo

Fix ToSchema instances

Secure API, part 2: Access control on NodeAPI

add new synchronic clustering

Eleve: merge my tests

[ELEVE] main specs more generic.

[ELEVE] Specifications to test to fix concurrent multi-terms.

[ELEVE] mainEleve' with a witness corpus

Secure API with JWT auth. Part 1

[FIX] servant-static-th update for new files in Front (sass).

working on perf

Merge branch 'dev' into dev-phylo

working on perf

[UPGRADE] stack version.