Revert "[OPTIM] removing long computations for now (TFICF)"

This reverts commit 5d658a437707babfde854557a10e9dd0e4e71561.

[VERSION] +1 to 0.0.4.7.3

[OPTIM] removing long computations for now (TFICF)

[FIX] mail prelude

[VERSION] +1 to 0.0.4.7.2

[stack] upgrade to lts 18.16

[Merge]

[MERGE] prelude pr

[mail] add HasMail class, use gargantext.ini for config

[MERGE] merging prelude

[TOOLING] sql queries to remove unused documents and ngrams from database. Usage: use a crontab to execute it every week for instance.

[flow] add better progress report to flow corpus

[VERSION] +1 to 0.0.4.7.1

[CLEAN] removing NgramsRepo which is not used any more

[VERSION] +1 to 0.0.4.7

[VERSION] +1 to 0.0.4.6.1

[FIX] Parser WOS

introduce EKG-based monitoring infrastructure

[VERSION] +1 to 0.0.4.6

Merge branch 'dev' into dev-graph-search-in-groups-not-in-labels

[VERSION] +1 to 0.0.4.5

[FIX] merge

[charts] sources chart sorted in ascending order

Also, add "Advanced" endpoint for node list update to update charts.

[document upload] fix to/from json

[document upload] fix path

[API] document upload endpoint

[graph] some more ngrams children work in graph

[graph] add ngrams to graph

This is not the optimal solution since it duplicates so much
data. Best would be to add "children" in the node directly.

Merge branch 'dev-doc-create-endpoint' into 'dev'

Dev doc create endpoint

See merge request gargantext/haskell-gargantext!64

[FIX] nix pk deps

[document upload] fix to/from json

[document upload] fix path

[API] document upload endpoint

[VERSION] +1 to 0.0.4.4

[FIX] docker off by default

Merge branch '81-dev-zip-upload' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[search] fix for plainto_tsquery for docs search

This is because to_tsquery doesn't work with multiple words not
separated by AND or OR.

[upload zip] add MAX_DOCS_PARSERS limit to ZIP/CSV upload

[upload zip] this works now

[upload zip] some more work on zipfile parsing

[corpus] attempt to implement zip as base-64 encoded file

Merge branch 'dev' into 81-dev-zip-upload

[FIX] commands and stack version to build

[parser] fix zip file name

[zip upload] some more work on zip file

[BIN] upgrade script

[git] add directories to .gitignore, add .envrc for direnv

[VERSION] +1 to 0.0.4.3

Merge branch '81-dev-zip-upload' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[upload] implement simple endpoint for zip file upload

[search] parse dates correctly

[frame write] date paser work, update lts to 18.12

This doesn't compile yet.

Merge branch 'dev-ilike-search-fix' into dev-corpora-from-write-nodes

Merge branch 'dev' into dev-corpora-from-write-nodes

[write nodes] use closest corpus as parent

[search] remove search_title in favor of the (previous) search column

[VERSION] +1 to 0.0.4.2

[FIX] haskell-opaleye update

Merge branch 'dev' into dev-corpora-from-write-nodes

[frame write] add missing module: DocumentsFromWriteNodes

[DOC] changelog

[VERSION] +1 to 0.0.4.1

[VIZ] code viz of the project

[Merge] and fix conflicts

Merge branch 'dev-ilike-search-fix' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[DOC] Changelog

[VERSION] +1 to 0.0.4

Merge branch 'dev-merge' into dev

[UPGRADE] execute devops/postgres/upgrade/0.0.4.sql to your database to upgrade

[frame write] implement flowDataText to insert docs into corpus

[DEP] haskell-opaleye dep upgrade

[write nodes] preliminary work for Write node adding to corpus

This is only the endpoint, it does nothing yet.

[schema.sql] fix with IF NOT EXISTS

Merge branch 'dev-ilike-search-fix' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[search_title] tsvector query fix for v11

Also, pin postgres to v11 so that we're compatible with Debian
upstream.

Merge branch 'dev' into dev-corpora-from-write-nodes

[DOC] ChangeLog

[VERSION] +1 to 0.0.3.9.1

Merge branch 'dev-ilike-search-fix' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge1

Merge branch 'dev' into 79-dev-rewrite-better-record-syntax

Merge branch 'dev' into dev-fix-node-update-endpoint

[postgres] remove node_pos index which is not immutable

This caused subtle bugs when ALTER TABLE with search_title was
called. It is a wrong practice to define an index immutable when in
fact it's not. The count(id) part makes it mutable in fact.

[search] successful search_title tsquery search

Merge branch 'dev' into dev-ilike-search-fix

[VERSION] +1 to 0.0.3.9

[VERSION] +1 to 0.0.3.8.1

[FIX] gource viz

Revert "[search] implement ts_query search"

This reverts commit 29ee19725ac50a79b9d657e771c829314e0845d0.

It introduces a bug, it should not be merged.

[VERSION] +1 to 0.0.3.8

[ADM] install scripts

[postgres] attempt to fix the tsvector issue

However, the code doesn't work currently.

[framewrite] parser is working now, much better

Order of authors, date, source doesn't matter and we can interleave contents.

Merge branch '79-dev-rewrite-better-record-syntax' into dev-corpora-from-write-nodes

[framewrite] better line parsing

[pasers] framewrite parser for fetching documents from framewrite node

[search] implement ts_query search

This has couple of drawbacks:
- we use postgres-simple and a raw sql query, opaleye would be better
I guess
- there is a hack for empty query, this should be replaced by
removing the WHERE clause in this case

[refactoring] more record syntax rewriting

[Graph API] fix corpus parent id for graph

Merge branch 'dev' into 79-dev-rewrite-better-record-syntax

[VERSION] +1 to 0.0.3.7