adaptative time scale with phylo 1click

change main

add Callon's density

merge with dev

Merge branch 'dev-phylo' of https://gitlab.iscpif.fr/gargantext/haskell-gargantext into dev-phylo

[MERGE]

[MERGE]

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.5

[FIX] removing debug prints

1 click phylo v1 is ok

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.9

[ADM] cabal update

Merge remote-tracking branch 'origin/475-dev-node-team-invite' into dev-merge

[FIX] Clustering improvement

[MERGE]

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.8

[MERGE]

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.7

[FEAT] Clustering with more granularity and structure

[DOC] ChangeLog

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-177-DoorWelcome-v2' into dev

[FIX] Order 2 regression and split of clustering

[API] Team members API for autocomplete

Merge branch 'dev' into 475-dev-node-team-invite

curious h2...

add sentence about frontend

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.6

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-177-DoorWelcome-v2' into dev

adding start script and complete readme

readme structure

Switch to hsparql-0.3.8

Switch to Hackage-released version of HSvm

This commit switches to an Hackage-released version of HSvm,
specifically 0.1.1.3.22, which is the same we were previously
relying on, but by pinning on a specific commit
`3fe28b683aba5ddf05e3b5f8eced0bd05c5a29f9` of the GitHub repo.

This also restores commit `243cfbb5e9e979611e55d97b2d0414587757a455`,
which got misteriously missing.

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.5

[FIX] Clean unused dependencies

Merge remote-tracking branch 'origin/adinapoli/drop-servant-static-th' into dev

[FIX] Crawler Arxiv Api

Merge remote-tracking branch 'origin/adinapoli/issue-180-deps-audit' into dev

Drop unused servant-static-th

This commit removes the `servant-static-th` dependency from the project,
because it turns out we weren't using this package, and furthemore we
were depending on a fork of the latter.

Switch to Hackage version of hstatistics

We were depending on Alexandre's fork of `hstatistics`, but in the
meantime his changes got merged upstream and the maintainer release
version `0.3.1` on Hackage, so this commit changes the `stack.yaml` file
to use that.

[DOC] README

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-177-DoorWelcome' into dev

WIP: readme

[DOC]

Merge remote-tracking branch 'origin/adinapoli/issue-180-deps-audit' into dev

[DOC] ChangeLog

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.4

[STACK] crawler pubmed fixes

Drop unused monad-logger-aeson dependency

Add script to track Haskell deps

[FIX] Opaleye Query

Restore tests

Add support for weeder

Add optional Accelerate dependency on Darwin for pkgs.nix

On Mac, building `gargantext` requires linking against the
Accelerate framework (completely unrelated to the `accelerate` Haskell
package!). This patch provides an extra `pkgs.nix` directive that will
kick in only when building on Darwin.

[opaleye] remove ReadNull type instances

They are changed to MaybeFields ...Read instead when joining.

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.3

Merge remote-tracking branch 'origin/175-dev-doc-table-count' into dev-merge

[refactor] upgrade opaleye to 0.9.6.1

Remove joins, use optionalRestrict instead.

Also, remove cabal.project because stack.yaml and package.yaml cover
dependencies already.

readme

Update README.md

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.2

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.1

[DEBUG] Message

[FIX] WOS Parser

[DOC]

[MERGE]

[DOC]

[FIX] #173 Ngrams Change insert causes Database error

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4

[FIX] BUG email/username uniforming to Lower case

[Node Write Analysis] Change types

Merge branch 'dev' into 164-dev-node-write-analysis

[WIP] How to graph my writings ?

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.3

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-hackathon-fixes' into dev-merge

[FEAT] Improving NodeWriteParsing

[refactoring] add StrictData option, refactor Data.Map to Strict

Based on the suggestions in
https://kodimensional.dev/space-leak

[graphql] fixes to the ngrams context endpoint

[DOC]

[FIX] NodeWrites parsing first fix

[nodestory] fix INSERT function so that it is performed only...

...when node_id exists in the DB

Warning: this silently avoids insertion of patches when node_id is
missing for some reason in the history.

Merge branch 'dev' into dev-hackathon-fixes

[graph] some refactoring of Core.Viz.Graph

[DOC]

[READ] Code clean

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.2

[FIX] List Learning is back

[Node write upload] Add params

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-hackathon-fixes' into dev

[social] fixes for more qualified imports

It's easier to find types and functions that are used in code this
way.

Merge branch 'dev' into dev-hackathon-fixes

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-hackathon-fixes' into dev

[graphql] endpoint for contexts_for_ngrams

[DOC]

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.1

[DOC]

[FIX] Advanced Bridgeness test

[DOC]

[graphql] nodeContext score update mutation

Merge branch 'dev' into dev-hackathon-fixes

[graphql] implement an endpoint for node contexts