Merge remote-tracking branch 'origin/adinapoli/issue-180-deps-audit' into dev

Switch to Hackage version of hstatistics

We were depending on Alexandre's fork of `hstatistics`, but in the
meantime his changes got merged upstream and the maintainer release
version `0.3.1` on Hackage, so this commit changes the `stack.yaml` file
to use that.

[DOC] README

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-177-DoorWelcome' into dev

WIP: readme

[DOC]

Merge remote-tracking branch 'origin/adinapoli/issue-180-deps-audit' into dev

[DOC] ChangeLog

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.4

[STACK] crawler pubmed fixes

Drop unused monad-logger-aeson dependency

Add script to track Haskell deps

Restore tests

Add support for weeder

Add optional Accelerate dependency on Darwin for pkgs.nix

On Mac, building `gargantext` requires linking against the
Accelerate framework (completely unrelated to the `accelerate` Haskell
package!). This patch provides an extra `pkgs.nix` directive that will
kick in only when building on Darwin.

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.3

Merge remote-tracking branch 'origin/175-dev-doc-table-count' into dev-merge

[refactor] upgrade opaleye to 0.9.6.1

Remove joins, use optionalRestrict instead.

Also, remove cabal.project because stack.yaml and package.yaml cover
dependencies already.

readme

Update README.md

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.2

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4.1

[DEBUG] Message

[FIX] WOS Parser

[DOC]

[MERGE]

[DOC]

[FIX] #173 Ngrams Change insert causes Database error

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.4

[FIX] BUG email/username uniforming to Lower case

[WIP] How to graph my writings ?

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.3

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-hackathon-fixes' into dev-merge

[FEAT] Improving NodeWriteParsing

[refactoring] add StrictData option, refactor Data.Map to Strict

Based on the suggestions in
https://kodimensional.dev/space-leak

[graphql] fixes to the ngrams context endpoint

[DOC]

[FIX] NodeWrites parsing first fix

[nodestory] fix INSERT function so that it is performed only...

...when node_id exists in the DB

Warning: this silently avoids insertion of patches when node_id is
missing for some reason in the history.

Merge branch 'dev' into dev-hackathon-fixes

[graph] some refactoring of Core.Viz.Graph

[DOC]

[READ] Code clean

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.2

[FIX] List Learning is back

[Node write upload] Add params

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-hackathon-fixes' into dev

[social] fixes for more qualified imports

It's easier to find types and functions that are used in code this
way.

Merge branch 'dev' into dev-hackathon-fixes

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-hackathon-fixes' into dev

[graphql] endpoint for contexts_for_ngrams

[DOC]

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.1

[DOC]

[FIX] Advanced Bridgeness test

[DOC]

[graphql] nodeContext score update mutation

Merge branch 'dev' into dev-hackathon-fixes

[graphql] implement an endpoint for node contexts

[FIX]

[TEST] Bridgeness Advanced is not filtering for tests

[DOC]

Merge remote-tracking branch 'origin/dev' into dev

[DOC]

[FIX] Duplicates

Merge branch 'dev' into dev-hackathon-fixes

[ngrams] fixes for list JSON import

Instruction for launching detailed

Update README.md Minor update - instruction for nix-env

[DOC] ChangeLog

[DOC]

[corpus] export json as attachment, doesn't open web page with json content

[FIX] cabal file

[ngrams] make ngrams search case-insensitive

Merge remote-tracking branch 'origin/481-dev-node-calc-upload' into dev

[VERSION] +1 to 0.0.6.9.0

[FEAT] FrameWrite Corpus improvement

[table] add option to sort by tag

[gexf] fixes to the GEXF file format

[export] texts: attachment with filename

[Node calc upload] options

[DOC] ChangeLog

[patch] fixes for missing transformWith clause in patch apply

[VERSION] +1 to 0.0.6.8.6

[ngrams] list csv/json export endpoints

[graphql] add description to UserInfo

[ngrams] WIP CSV export work

[envrc] export LANG to fix some ghc compile errors

[FIX] API upload

[MERGE] stack repo

[VERSION] +1 to 0.0.6.8.5.9.4

[FIX] Pubmed API

[FIX] cabal file

Merge branch 'dev' into 161-dev-conduit-insert-db-fix

[ngrams] sort based on duplicates elimination

Related to https://gitlab.iscpif.fr/gargantext/purescript-gargantext/issues/441

[jobs] add JS_JOB_TIMEOUT/JS_ID_TIMEOUT settings for jobs

[flow] some refactoring so that nodes are created in separate function

[VERSION] +1 to 0.0.6.8.5.9.3

[FIX] update cabal

Merge remote-tracking branch 'origin/161-dev-conduit-insert-db-fix' into dev-merge