[WIP] bridgeness optim

[WIP] need more optimization

[WIP]

[WIP] bridgeness2 needs optim

[STASH] back to old work

[CLEAN] Code

[FEAT] Graph Multipartite connected, need to change the node shape in Graph and tests

[REBASE]

Merge remote-tracking branch 'origin/flexible-job-queue' into dev

[MERGE]

introduce and use a flexible job queue system

[gargantext.ini] add BACKEND_NAME

[FEAT] Giving the instance Name to the user

[VERSION] +1 to 0.0.6.7.1

[OPTIM] Ngrams Table query

[ngrams] some attempt to fix query with sample (contexts)

[VERSION] +1 to 0.0.6.7

[FIX] Nodes with one edge only are removed now

[FIX] pubmed threaddelay

[WIP] specification for optimization

[DOC] Changelog

[VERSION] +1 to 0.0.6.6

[FEAT] Enabling confluence in backend

[DOC] With issues

[DOC] Changelog

Doc

[ADM] maintenance page

[DOC] Changelog

[MERGE] dev-phylo

[VERSION] +1 to 0.0.6.5.1

[ngrams] attempt to fix repo conflicts with `transformWith`

But I'm not sure I know what I'm doing...

[DOC] Changelog

[VERSION] +1 to 0.0.6.5

[FIX] HAL et ISTEX APIs

[FIX] change leader to owner

Merge branch 'dev-merge' into dev

fix script

[DOC] changelog

[DOC] changelog

[VERSION] +1 to 0.0.6.4

Merge remote-tracking branch 'origin/438-dev-team-node-creator' into dev-merge

[GQL] Add team leader to query

[VERSION] +1 to 0.0.6.3

[DOC] default folder name

[FEAT] Backend NLP French tested

[DEBUG] message

code review/design

Doc/Comments

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-phylo' into dev-merge

[FIX] Graph Spatialization without confluence

Merge remote-tracking branch 'origin/fix-confluence-indices-bugs' into dev

Fix confluence re-indexing bugs

[FIX] Invitation script

[DOC] IsTex API TODO for alter

[FIX] IsTex without scrolling finally

Merge remote-tracking branch 'origin/141-dev-node-stories-db-optimization' into dev

[nodeStory] fix delete query

[FIX] upgrade script

[nodeStory] attempt to fix type error for sql

Merge branch 'dev' into 141-dev-node-stories-db-optimization

[nodeStory] fix version ordering

[ADMIN] Upgrade script tested

[FIX] script needs backup

script update

[ADMIN] Upgrade scripts

[FIX] commenting to fix graph issue

[DOC] Changelog

[FIX] HAL changed its schema

[VERSION] +1 to 0.0.6.2

[nodeStory] some attempts to fix showing errors for PGS execute

Merge remote-tracking branch 'origin/debug-nans' into dev

[nodeStory] add immediate saver

This is used to save when quitting the server. Previous, debounce
save, didn't work properly on exit.

[nodeStory] add version to node_story_archive_history

This is so that we correctly order _a_history later.

seemingly fixed 'computeConfluences'

Merge branch 'dev' into 141-dev-node-stories-db-optimization

[nodeStory] fix runPGSExecuteMany calls, remove debugging prints

[postgres] fix 0.0.6.0 script name, sorting is better

oops

[FIX] schema.sql needs upgrade too.

[DOC] ChangeLog + spacy server on tmux script

[FIX] Duplicates removed with hash computed on text filtered

[DOC] ChangeLog

[FIX][Parser] PubMed bans if too many requests are done per second. Adding a threadDelay seems to fix the issue for now.

[DOC] ChangeLog

[MERGE] Upgrading postgresql and ngrams repo changes

[DOC]

Merge remote-tracking branch 'origin/garg-init-errror-msg' into dev-merge

[VERSION] +1 to 0.0.6.1

[FEAT] NLP using Spacy Server

Check that garg-init has been executed at startup, abort with helpful error if not

[nodeStory] insert/delete/update seems to work, needs more verification

[FIX] prepareText

[FEAT] Prepare text from Gutemberg

[WIP] how to clean data text coming from a Book from Gutemberg

[nodeStory] insert/update/delete state handling

This doesn't work with locks yet.

[postgres] upgrade postgres to version 14

[CLEAN] readFile homonyms

[README] upgrade postres: info about volume

[README] updated with section on upgrading postgres in docker

Merge remote-tracking branch 'origin/dev-merge-nix-2' into dev