[DB|WIP] fix imports and cycles

[WIP][REFACT] imports fixed

[FACTO/WIP] files org and import fix in Database/*

[ADM] doc for gargantext.ini

[ADM] ini file fixed

[GIT] ignoring *sql

[FIX] Missing files

[WIP/DB] Refactoring (start).

[WIP] Starting query Garg for a Hello Word.

[Flow] with userId own Tree : OK mergeable.

[Flow] using user id. TODO : tests.

[Graph] clean

Merge branch 'dev' into dev-graph-explorer-gexf

[Graph] back to cLouvain c++ for tests/demo

Remove inMVar and inMVarIO

MonadBase replaces MonadIO

WIP connection pool

[FIX] newPool

Merge branch 'dev' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

WIP connection pool

[DB] gargPool

[API] Add corpus username/uid.

[Async] Corpus New addToCorpusWithForm

[Jobs] Instances Show ScraperStatus

where->let

Debug info in addCorpusWithForm

[ASYNC] for tests

[Async] back (corpus input test) but still needs work.

Merge branch 'dev-graph-async' into dev

Merge branch 'patch-1' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-patch

[graph] graph versoin refresh endpoint

Correct possible typo

[Graph] more graph async work

[Graph] getGraph doesn't recompute new graph version

Instead, I added a 'recomputeGraph' function to call it via servant
job. getGraph computes new graph only when it doesn't exist.

[Graph] Haskell version removing the c++ one (tech+legal issue mainly).

[GRAPH] Async Route

lists endpoint should accept JSON

[FIX] Garg Version api.

Merge branch 'dev-version' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

Merge branch 'update-build-shell-nix-merge' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[Optims]

[version] add version info

NOTE: API doesn't compile yet.

Merge branch 'update-build-shell.nix' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into update-build-shell.nix

update shell.nix nixpkgs

update build-shell.nix and add gfortran as extra-libraries

this makes `stack build --nix` work without extra system dependencies

[graph] add gexf API endpoint

[Graph] add gexf exporter to graph endpoint

[docker] update image, add README info

[OPTIM] MVar for Graph Clustering.

[DOC] comments

[FEAT] post list now set new list as list (and remove previous one).

[FEAT] NgramsList upload

[FIX] Lists route.

Merge branch 'dev-file-name' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[API] file name added to corpus new endpoint

Merge branch 'dev-list-downloadable-with-content-type' into dev

[FIX] cosmetics name

[List] filename for content-disposition

[FIX] addHeader - String -> Text

[List] fix Content-Disposition

[List] add Content-Type header info to list download

Unfortunately, this doesn't compile.

[API] disable xsrf for cookie GET requests

Also, list API works now.  Only the file isn't downloaded yet.

Merge branch 'dev' into update-build-shell.nix

update shell.nix nixpkgs

update build-shell.nix and add gfortran as extra-libraries

this makes `stack build --nix` work without extra system dependencies

[FIX] SQL read only

[list] add HTML list get endpoint

[OPTIM] concurrent threads (fix mem leaks)

[FIX] Graph concurrency.

pin nixpkgs and prepare shell.nix

[API] get / put NgramsList (todo: tests)

[FIX] Tree root design fun.

[NodeUser] fake data (basic)

[API] Node User

[FEAT] NodeUser type.

[PAR] fib route

[FIX] Tree filtering.

[FEAT] getMaxCliques function.

Merge branch 'dev-phylo' into dev

Merge branch 'dev-phylo' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-phylo

working on export

[FIX] merge

[Dashboard] allow storing charts in the dashboard node

[static] use file server, this way index.html is served by default

[static] fix API ordering

Static (at root) has to be last so that API matches.

[static] use servant static file server

This is instead of the Servant.Static.TH which bundles the files at
compilation into the binary.

[FIX] Annuaire / Team Node creation

Merge branch 'dev-merge' into dev-dashoard-charts

Merge branch 'dev' into dev-dashoard-charts

cosmetics reading

Merge branch 'dev-dashoard-charts' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

Merge branch 'dev-getting-started-readme' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

Merge branch 'dev' into dev-getting-started-readme

add branch w and t

[annuaire] typo fix in annuaire async upload url

[Annuaire] async file upload stub

[nix] use gfortran.cc.lib

[INIT] add main folders.

Merge branch 'dev' into dev-getting-started-readme

[DOC] preparing maxClique phylo