[FIX] merge dev-phylo

[FEAT] Order 1 and 2 implemented.

[FIX] clustering, order 2 similarity, ok

[FEAT] Distributional Measure Similarity in Graph Flow (WIP)

fix package and cabal

save a phylo with cliques

merge with dev

git add step files

Merge branch 'dev' into dev-small-fixes

[refactoring] small fixes for imports, garg ini

[VERSION] +1 to 0.0.2.8

[FEAT] new clustering algo by default (Spinglass)

add label to sha

Merge branch 'dev-distributional' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[FEAT] Implements log distributional function with accelerate (#50).

[FIX] warning

[FEAT] IGraph partitions complement

first commit

[CLEAN] sugared funs

[FUN] with filePath

add legacy files

refactoring 2021, remove old phylo files, keep API

Merge branch 'dev-kawen' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[ngrams] add score update endpoint + sorting

[FIX] typo

[README/INSTALL] Update image versions

[nginx] frames websocket endpoint

[DEVOPS] nginx frames config

[DEVOPS] nginx default config

[CLEAN]

[FIX] removing anonymous function

[FIX] ViewScore instances

[FIX] logs folder for logs

[PARAM] List cut of Candidate Ngrams

[FIX] Default Hyperdata Dashboard

[ADMIN] save logs

Merge branch 'dev-merge' into dev

[FIX] Louvain parameter

[VERSION] +1 to 0.0.2.7.1

[FIX] map list to 0

Merge branch 'dev' into dev-node-board-add-text-cells

[VERSION] +1 to 0.0.2.7

Merge branch 'dev-merge' into dev

Merge branch 'dev' into dev-node-board-add-text-cells

Revert "[phylo] quality function reparameterized to have high levels for lambda-->1 and low levels for lambda-->0"
Push error

This reverts commit defa83d95af2aac38112fbe71d368397ea4be6e1.

[FIX] CNRS org by default

[FIX] User Layout

Merge branch 'dev-node-board-add-text-cells' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[dashboard] add missing CorpusField.hs file

Merge branch 'dev-node-board-add-text-cells' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[FIX] Contact Search

[dashboard] add 'fields' to hyperdata

[DEMO] read any file to get annuaire

[DEMO] new format for IMT Annuaire.

[phylo] working on file naming function. Now OK2 but branch length is still missing

[phylo] working on file naming function. Now OK but branch length is still missing

Merge branch 'dev-ngrams-table-online' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[ngrams] add missing VersionedWithCount functions

[phylo] changing the name of reclustering parameter in naming function from 'level' to 'hlev'

[phylo] specification of the type of intertemporal matching in the output name

parameter change in sensibility to have a [-1 1] range

[FIX] html update

[FIX] typo

[DOC] model for maintenance page on nginx

[FIX] normalize username when sharing

Merge branch 'dev-phylo' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-phylo

[OPTIM] Insert ngrams

working on a new distance in phylo

[OPTIM]

[FIX] more strict data

[DOC] typo

[FIX] memory fix

[VERSION] +1 to 0.0.2.6

[UPGRADE] main functions

[ngrams API] added VersionedWithCount to ngrams output

[ngrams API] initial work for getting total ngrams count

[BIN] upgrade binary for PosTags

[UPGRADE] main functions for upgrade (WIP)

fix synchrony

Merge branch 'dev-phylo' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-phylo

parameter change in the sensibility for WeightedLogSim and WeightedLogJaccard similarity measures to have continuous function in 0

New similarity measure for inter-temporal matching added named WeightedLogSim Adapted from Wang, X., Cheng, Q., Lu, W., 2014. Analyzing evolution of research topics with NEViewer: a new method based on dynamic co-word networks. Scientometrics 101, 1253–1271. https://doi.org/10.1007/s11192-014-1347-y (log added in the formula + pair comparison)

[FIX] clean groups + handling duplicates (TODO inside)

[FIX] lang + algo for select + fix warnings

filter the clique by neighbours

Merge branch 'dev' into dev-ngrams-groups

Merge branch 'dev' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-ngrams-groups

[TEST Q] ok (needs some refact still)

[FIX] insertion is ok now.

[ini] strip trailing slash from ini urls

[FEAT] group ngrams, connected (testing now)

[TYPES] group type for lems

[FEAT] SQL fun to get lems

[FIX] ngrams + ngramsPosTag insert

fix ancestors on a single branch

in clustering synchronique change to 1 / sensibility

[phylo] Inversion of level range in re-parameterization

[phylo] quality function reparameterized to have high levels for lambda-->1 and low levels for lambda-->0

[WIP] needs improved type

Merge branch 'dev' into dev-ngrams-groups