Merge branch 'dev' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[DOC] Defaut hyperdata position

change beta to lambda [0...1]

[README] update with info on how to compile faster

break the branches from the largest to the smallest branch

add a parameter in the config for finding the ancestors or not

process the ancestors before the synchronic clustering

[FIX] bug invitation

[DEBUG]

[VERSION] +1 to 0.0.2.5

Merge branch 'dev-tree-reload' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[tree] fix for public nodes being shown (PublicDirect type)

[TEXTFLOW] enriched ngrams connected

[FIX] undefined lacking functions

[TextFlow REFACT] addin ExtractedNgrams type for simple or enriched ngrams extraction

[OPTIM] HashMap Ngrams ...

[REFACT/CLEAN] TextFlow

[REFACT] Indexed type more generic

[CLEAN] replace NgramsTerms with Text to avoid ambiguity with Types of Ngrams

[REFACT] Types

[Type] Indexed generic and polymorphic type to save database id with core garg types.

[REFACT] Types work (WIP)

[FIX] typos

Merge branch 'dev' into dev-ngrams-groups

[Prelude.Crypto.Share] WIP / Clean

[CryptoRandom] wip

[VERSION] +1 to 0.0.2.4

merge

Merge branch 'dev-merge' into dev

Merge branch 'dev-tree-reload' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[FIX] back to Conditional distance

[FIX] merge

[docker] 'host' network mode is incompatible with 'ports'

[tree] remove printDebug and add comment for shared direct tree

[tree] some Tree query work

[REFACT] HasDBid instance for ListType

[CODE ERGO] Instance method renamed

[FIX] Instances declations: HasDBid NodeType (more ids for types coming)

[REFACT] HasDBid

[FIX] sql return

[FEAT] SQL fun to insert postagging

[DATABASE] New Table for postagging

Merge branch 'dev-lts-16.26-upgrade' into dev-tree-reload

[stack] upgrade to 16.26 lts (Docker too)

[temp] some debugging code for the tree reload fix

[FEAT] Implementing distributional function with matrix computation.

[CLEAN] Social.Scores unused. Use History of patches instead

[VERSION] +1 to 0.0.2.3

[FIX] Warnings unused imports

[FIX] HashMap lacking functions in main lib

[FIX] Map Text -> HashMap NgramsTerm

Merge branch 'dev-social-list' into dev-merge

Merge branch 'dev-refactor-metrics' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[CLEAN] fix warnings

[FEAT/FIX] Stemming -> Parent/Children -> Patch ok

[FIX] History patch working, bug several NRE fixed, needs stemming scores now

add src/Gargantext/Data/HashMap/Strict/Utils.hs

Merge branch 'dev-merge' into dev

Merge branch 'dev-refactor-metrics' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[FIX] ListType working now with history patch

Continue refactoring...

[FIX] stack config

Merge branch 'dev-tree-reload' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[tree] refactor "root" variable name

[FEAT] Patch Scores key with max value if non positive case

[FIX] Patch Scores: Nothing Nothing case

[FEAT] Improving patch to scores

[Patch Scores] needs tests

[FEAT] Patches to scores (WIP)

[tree] refactor "root" variable name

[History Patch] Type : User | NotUser | AllHistory

[Scores of PatchMap] main fun (WIP)

[Patches Scores] new ngrams case

[FEAT] Patch new / old implemented

[FIX] dep with cabal file

[FEAT] lens for flowcont and flowlistscores (wip)

[FIX] User History of patches, ok

[REFACT] more generic history of patch

[FIX] remove PatchMap to Map for History of patches

[FEAT] Social Lists on History (WIP)

[MERGE]

[FIX] Invitation if completed corpus exists

Merge branch 'dev-tree-reload' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev

[FIX] API data external connection (HAL)

[VERSION] +1 to 0.0.2.2.1

[FEAT] SendMails workflow + refactor

[FIX] removing no warnings for shadowing

[ORG] Mail organization

[FIX] warning unused var

Merge branch 'dev-tree-reload' of ssh://gitlab.iscpif.fr:20022/gargantext/haskell-gargantext into dev-merge

[FIX] PubMed parser

[FIX] email model

[tree] first-level API implementation

[VERSION] +1 to 0.0.2.2

[FIX] Pubmed parser

[VERSION] +1 to 0.0.2.1

[FIX] Shared corpus in the same hierarchy for now

WIP refactoring

[FIX MERGE] with dev and testing (social lists)

[FIX] nix shell build.